比较基因组分析Yarrowia lipolytica BBE 组分其中42577个是比较纯合SNP

焦点2025-05-10 23:46:013

2、比较单核苷酸多态性和小片段插入与缺失的基因分析

与参考基因组相比,Yarrowia lipolytica BBE-17共有43921个单核苷酸多态性(SNP)变化(图3),组分其中42577个是比较纯合SNP,1344个是基因杂合SNP,27515个是组分转换的SNP,16406个是比较颠换的SNP,有7871个是基因同义突变,3711个是组分非同义突变;位于基因间区的SNP突变有32339个,每1000bp序列平均有2.4个单核苷酸多态性变化。比较整个基因组有8078个小片段插与缺失变化(InDel),基因其中插入的组分片段是3924个,缺失的比较片段是4154个,有7740个是基因纯合变化,有338个是组分杂合变化。有4256个基因发生了单核苷酸多态性变化,但是没有基因发生小片段插入或缺失的变化。

a1

a2

3、基因组结构变异分析

基因组结构变异(SV)指基因组水平上大片段的插入,缺失、倒置、易位等序列。与参考基因组比对发现,有129个大片段的基因组结构变异(图4)。其中缺失片段106个,倒置片段2个,染色体内部迁移7个,染色体间的迁移14个,有44个发生在基因间区,64个结构变异发生在基因中。份BBE-17结构变异所涉及的基因有109个,全部为缺失型变化(表1)。

a4

声明:本文所用图片、文字来源于《中国食品添加剂》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系。

相关链接:单核苷酸基因间区基因组结

本文地址:http://c20uxrq.hrtwrk.com/news/89a34699564.html
版权声明

本文仅代表作者观点,不代表本站立场。
本文系作者授权发表,未经许可,不得转载。

全站热门

盛夏已至!全国入夏进程图出炉 哪里夏天来得越来越早了

富硒寿乡,连州超40万亩良田开耕!

福建:强化约谈监督 防范化解食品安全风险

打击整治养老诈骗专项行动 |受骗超500人、金额逾百万  浙江杭州查处一起养老诈骗案

砀山县文旅体局关工委常务副主任曹莉:余热生辉 关爱下一代

福建莆田:尚口福等10家外卖餐饮店因假证等问题被曝光

山东济宁:“标准化”为企业发展插上腾飞的翅膀

北京丰台强化暑期特种设备安全检查

友情链接

    辽ICP备97645398号